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| 明治 ２ 年１０月 | 松前藩旧官舎を医院仮事務所として林洞斎医師らが診療開始 |
| 明治 ５ 年 | 官立根室病院開設 |
| 明治３３年 | 根室町の管理となり町立根室病院に改称 |
| 昭和２０年 ７月 | 官立根室病院開設 |
| 昭和２１年 | 再建 |
| 昭和３２年 ８月 １日 | 市政施行に伴い市立根室病院となる |
| 昭和３２年１０月１４日 | 市立根室病院開設 |
| 昭和３３年 |
診療棟・管理棟増改築 鉄筋コンクリート２階建２，１８４平方メートル 診療科 内科・外科・小児科・産婦人科・眼科・耳鼻咽喉科 |
| 昭和４０年 |
精神病棟新築 鉄筋コンクリート３階建 １０６床 １，４５８平方メートル |
| 昭和４１年 ３月１６日 |
総合病院名称認可 診療科 内科・外科・小児科・産婦人科・整形外科・耳鼻咽喉科・眼科・精神科 |
| 昭和４１年～４３年 |
病棟・診療棟増改築 鉄筋コンクリート地下１階地上５階建 一般病床２０２床 ６，５３０平方メートル 看護婦宿舎増改築 |
| 昭和５６年１０月 ８日 |
救急病院の認定 救急病室６床 |
| 昭和５８年 １月３１日 |
人工透析室設置 |
| 昭和６０年 ５月 ８日 |
ＣＴ室増築 |
| 昭和６０年 ７月１９日 |
精神病棟１０６床廃止 |
| 昭和６３年 ７月１４日 |
結核病棟７床減少、リハビリ渡り廊下及び霊安室増築 |
| 平成 元年１２月２５日 |
地域センター病院指定 |
| 平成 ５年 ９月 １日 |
基準看護特２種承認 |
| 平成 ６年 ４月１９日 |
結核病棟全床（３１床）廃止 |
| 平成 ９年 ４月 １日 |
泌尿器科設置 「理学療法科」を「ﾘﾊﾋﾞﾘﾃｰｼｮﾝ科」に名称変更 |
| 平成 ９年１２月２５日 |
災害拠点病院（地域災害医療センター）指定 |
| 平成１１年 ３月２９日 |
ＭＲＩ棟増築 |
| 平成１１年 ４月 １日 |
伝染病床２３床廃止 |
| 平成１２年 ６月 １日 |
ペースメーカー移植術、ペースメーカー交換術病院指定 テレパソロジーによる病院組織迅速顕微鏡検査病院指定 |
| 平成１２年 ７月２４日 |
遠隔医療システム供用開始 |
| 平成１３年 ５月１４日 |
心臓血管外科設置 |
| 平成１３年１０月 １日 |
ペインクリニック開設 |
| 平成１４年 ４月 １日 |
脳神経外科設置 一般病床２０２床から１９９床へ（３床減） |
| 平成１５年 ７月 １日 |
循環器科、呼吸器科、消化器科設置 |
| 平成１９年 ４月 １日 |
一般病床５５床休床し３病棟１４４床とした。 |
| 平成２０年１０月 １日 |
マルチスライス型ＣＴ設置 |
| 平成２１年 ２月 ３日 |
ペインクリニック開設 |
| 平成２５年 １月２９日 |
新病院仮開院 延床面積 １３，２８１㎡ 鉄筋ｺﾝｸﾘｰﾄ造一部鉄骨 鉄筋ｺﾝｸﾘｰﾄ造（基礎免震構造） 地上４階、地下１階 許可病床数１３５床（一般１３１床、感染症４床） |
| 平成２６年 １月 ６日 | 市立根室病院 新病院 全施設共用開始 |
| 平成２７年 ４月 １日 | 地方公営企業法全部適用 |
| 平成２９年 ４月 １日 | 一般病床１３１床のうち１８床を地域包括ケア病床として運用開始 |
| 令和 ５年 ４月 １日 |
稼働病床を一般病床２８床休止し、２病棟１０７床とした （許可病床１３５床は変更なし |
（令和５年４月１日現在）